Главной достопримечательностью Пречистенского Кафедрального Собора является уникальный для Литвы классический пятиярусный иконостас.
Не смотря на то, что Пречистенский собор был красой и гордостью литовской столицы, в нём проходили патриаршие богослужения, достойнейшие кандидаты возводились в митрополичий сан, а подвальные помещения служили усыпальницей литовских князей, сам собор неоднократно подвергался запустению и разрушениям.
Началом нового возрождения собора стал 1864 год. Автором возобновленного иконостаса Пречистенского собора стал многолетний староста прихода, директор виленской рисовальной школы, академик И. П.Трутнев. В ходе работ иконостас был поднят ещё на один ярус и стал пятиярусным, а по сторонам появились два новых иконостаса в четыре яруса. Сейчас более семидесяти икон выполненных в академическом стиле украшают храм.
Иконостас состоит из пяти рядов икон увенчанных Крестом. Структура иконостаса: Верхний ряд или чин называется праотеческий, который представляет собою первоначальную Ветхозаветную Церковь от Адама до закона Моисеева т.е. период подзаконный в лице Ветхозаветных праотцев с соответствующими текстами на свитках. Там вы можете увидеть Авраама, Иссака, Иакова, Адама, Мельхисидека, Ноя и.т.д. Центральная икона этого ряда – есть Образ Святой Троицы явление Ветхозаветной Троицы Аврааму. Следом за этим рядом, если смотреть снизу – ряд пророческий, который представляет Ветхозаветная Церковь от Моисея до Иисуса Христа – период закона Моисеева. Он состоит из изображений пророков со свитками на которых начертаны пророчества о грядущем Боговоплощении Мессии – Иисуса Христа. В центре этого ряда – образ Знамение Божией Матери, то есть образное переложение пророчества пророка Исаии, которое звучит так: „сего ради даст Господь Сам вам знамение, се Дева во чреве примет, и родит Сына, и нарекут имя Ему Иммануил, что значит с нами Бог“. Эти оба ряда праотеческий и пророческий показывают предображение Церкви Новозаветной. Икона Воплощения Богородицы указывает на непосредственную связь между Новым Заветом и Ветхим Заветом. Каждый из этих рядов представляет определенный период Священной истории и соотносится с центральной иконой как вершиной пророчеств. Третий сверху ряд – праздничный ярус. Он представляет собою уже период Нового Завета, после Рождества Христова – период благодатный. Здесь изображены, те события Нового Завета которые составляя годовой литургический круг празднуется Церковью и состоит из 12 икон по числу Двунадесятых Праздников Православной Церкви: Рождество, Крещение, Сретение, Вход во Иерусалим, Вознесение, Преображение, Рождество Богородицы, Введение во храм, Благовещение, Успение, а также двух экклесиологических праздников подвижного цикла: Пятидесятницы и Воздвижения Креста. Центральной иконой этого ряда является икона Тайной Вечери или Евхаристия, которая помещена над Царскими Вратами, т.к. место у Царских врат, это то место, где совершается Причащение. Четвертый сверху ряд называется деисусным. Смысловым центром этого ряда является икона Спасителя, представленного, как правило, в образе грозного Судии, явившегося судить мир. Справа и слева от Иисуса Христа изображаются Богоматерь и Иоанн Предтеча. За ними следуют архангелы, святители, апостолы, мученики, преподобные, т.е. сонм святых, представленный всеми чинами святости. Основная тема деисусного чина – моление церкви за мир. Достигшие святости и вступившие в Царство Небесное представители земного мира, образующие во главе со Христом Церковь Небесную, молитвенно предстоят престолу Христа-Судии, испрашивая снисхождения к собранной в храме Церкви земной. Местный ряд. В последнем, нижнем ярусе иконостаса по обеим сторонам от царских врат помещаются иконы Спасителя и Богоматери, а рядом с образом Христа – храмовая икона. В нашем храме это – икона Успения Божией Матери. Выбор остальных икон ряда зависит от местных потребностей и характера храма. Местные иконы представляют собой предмет наиболее близкого и непосредственного общения и почитания. Северные и южные врата иконостаса ведут в диаконник и жертвенник, на них изображены либо архангелы, либо святые диаконы как сослужители священников при совершении литургических ритуалов. Царские врата, ведущие в алтарь, являются составной частью иконостаса и существуют со времени первоначального устройства алтарной преграды. Уже в 5–6 вв. они украшались священными изображениями. Обычно на царских вратах помещается «Благовещение», а под ним образы четырех Евангелистов. Символически царские врата означают вход в Царство Божье. Благовещение знаменует начало спасения человечества и одновременно воплощает ту самую «весть», которая была возвещена миру евангелистами. Над царскими вратами изображается «Причащение апостолов» или «Евхаристия» в знак того, что в алтаре происходит причащение священников, а на солее перед царскими вратами – причащение верующих. В символическом смысле иконостас, так же как и храм, представляет собой образ Церкви. Однако если храм есть литургическое пространство, включающее в себя собрание верных, то иконостас показывает становление Церкви во времени от Адама до Страшного суда, являя собой образ будущего богообщения в новом преображенном мире. «Евхаристия», представленная в декорации царских врат, будучи образом возобновляющегося в богослужении спасительного события, произошедшего некогда на Тайной вечере, объединяет и охватывает все времена, соединяет временное и вечное, земное и небесное. Характерной чертой является, то что в иконостасе Пречистенского Собора присутствует целый сонм святых – выходцев из нашего края. Об этом существуют свидетельства учеников И. П.Трутнева, изучавших историю края, что явилось в последствии наглядной исторической летописью края в иконостасе Пречистенского собора – преподобная Евфросиния Полоцкая (+1173г.), преп. Кирилл Туровский (+1194г.), преп.Евпраксия, псковская княгиня, дочь литовского князя Рогволда Борисовича (1243г.). В иконостасе Пречистенского собора имеется икона св. Иулиании, княжны Ольшанской, происходившей из рода Великих князей Литовских (+1540). Есть изображение Св. Феодора, в миру князя Федора Острожского, – мужественного защитника православия против насилий, бывших при короле Ягайле (+1435 г.). По словам бывшего настоятеля Пречистенского Собора протоиерея Диониссия, все иконы относящиеся к святым нашего края находятся в иконостасе правого Макарьевского предела, история происхождения всех икон в данном пределе до конца не изучена.